细胞凋亡中染色体DNA的断裂是个渐进的分阶段的过程，染色体DNA首先在内源性的核酸水解酶的作用下降解为50-kb的大片段。然后大约30﹪的染色体DNA在Ca2和Mg2依赖的核酸内切酶作用下，在核小体单位之间被随机切断，形成～bp核小体DNA多聚体。
DNA双链断裂或只要一条链上出现缺口而产生的一系列DNA的3’-OH末端可在脱氧核糖核苷酸末端转移酶（TdT）的作用下，将脱氧核糖核苷酸和荧光素、过氧化物酶、碱性磷酸化酶或生物素形成的衍生物标记到DNA的3-末端，从而可进行凋亡细胞的检测，这类方法一般称为脱氧核糖核苷酸末端转移酶介导的缺口末端标记法（TUNEL）。由于正常的或正在增殖的细胞几乎没有DNA的断裂，因而没有3’-OH形成，很少能够被染色。低分子量的DNA分离后，也可使用DNA聚合酶进行缺口翻译（nicktranslation），使低分子量的DNA标记或染色，然后分析凋亡细胞。TUNEL或缺口翻译法实际上是分子生物学与形态学相结合的研究方法，对完整的单个凋亡细胞核或凋亡小体进行原位染色，能准确的反应细胞凋亡最典型的生物化学和形态特征，可用于石蜡包埋组织切片、冰冻组织切片、培养的细胞和从组织中分离的细胞的细胞凋亡测定，并可检测出极少量的凋亡细胞，灵敏度远比一般的组织化学和生物化学测定法要高，因而在细胞凋亡的研究中已被广泛采用。一、过氧化物酶标记测定法原理：脱氧核糖核苷酸衍生物地高辛[（digoxigenin）-11-dUTP]在TdT酶的作用下，可以掺入到凋亡细胞双链或单链DNA的3-OH末端，与dATP形成异多聚体，并可与连接了报告酶（过氧化物酶或碱性磷酸酶）的抗地高辛抗体结合。在适合底物存在下，过氧化物酶可产生很强的颜色反应，特异准确的定位出正在凋亡的细胞，因而可在普通光学显微镜下进行观察。毛地黄植物是地高辛的唯一来源。在所有动物组织中几乎不存在能与抗地高辛杭体结合的配体，因而非特异性反应很低。抗地高辛的特异性抗体与脊椎动物甾体激素的交叉反应不到1％，若此抗体的Fc部分通过蛋白酶水解的方法除去后，则可完全排除细胞Fc受体非特异性的吸附作用。本方法可以用于福尔马林固定的石蜡包埋的组织切片、冰冻切片和培养的或从组织中分离的细胞凋亡测定。(一)试剂配制1、磷酸缓冲液PBS（pH7.4）：磷酸钠盐50mM，NaClmM。2、蛋白酶K（μg/ml，pH7.4）：蛋白酶K0.02g；PBSml。3、含2%H2O2的PBS缓冲液（pH7.4）：H2O22.0ml；PBS缓冲液98.0ml。4、TdT酶缓冲液（新鲜配）：Trlzma碱3.63g用0.1NHCl调节pH至7.2，加ddH2O定容到0ml；再加入二甲砷酸钠29．96g和氯化钴0.g。5、TdT酶反应液：TdT酶32μl；TdT酶缓冲液76μl，混匀，置于冰上备用。6、洗涤与终止反应缓冲液：氯化钠17.4g；柠檬酸钠8.82g；ddH2O0ml7、0.05％二氨基联苯（DAB）溶液：DAB5mg；PBS10ml，pH7.4,临用前过滤后，加过氧化氢至0.02%。8、0.5％甲基绿（pH4.0）：甲基绿0.5g；0.1M乙酸钠ml。9、％丁醇，％、95％、90％、80％和70％乙醇，二甲苯，10％中性甲醛溶液，乙酸，松香水等。10、过氧化物酶标记的抗地高辛抗体（ONCOR）（二）实验步骤1、标本预处理：（1）石蜡包埋的组织切片预处理：将组织切片置于染色缸中，用二甲苯洗两次，每次5min。用无水乙醇洗两次，每次3min。用95％和75％乙醇各洗一次，每次3min。用PBS洗5min加入蛋白酶K溶液（20ug／ml），于室温水解15min，去除组织蛋白。用蒸馏水洗4次，每次2min，然后按下述步骤2进行操作。（2）冰冻组织切片预处理：将冰冻组织切片置10％中性甲醛中，于室温固定10min后，去除多余液体。用PBS洗两次，每次5min。置乙醇：乙酸（2：1）的溶液中，于-20℃处理5min，去除多余液体。用PBS洗两次，每次5min，然后按下述步骤2进行操作。（3）培养的或从组织分离的细胞的预处理：将约5×个/ml细胞于4％中性甲醛室温中固定10min。在载玻片上滴加50～μl细胞悬液并使之干燥。用PBS洗两次，每次5min，然后按下述步骤2进行操作。2、色缸中加入含2％过氧化氢的PBS，于室温反应5min。用PBS洗两次，每次5min。3、用滤纸小心吸去载玻片上组织周围的多余液体，立即在切片上加2滴TdT酶缓冲液，置室温1～5min。4、用滤纸小心吸去切片周围的多余液体，立即在切片上滴加54μlTdT酶反应液，置湿盒中于37C反应1hr（注意：阴性染色对照，加不含TdT酶的反应液）。5、将切片置于染色缸中，加入已预热到37℃的洗涤与终止反应缓冲液，于37℃保温30min，每10min将载玻片轻轻提起和放下一次，使液体轻微搅动。6、组织切片用PBS洗3次，每次5min后，直接在切片上滴加两滴过氧化物酶标记的抗地高辛抗体，于湿盒中室温反应30min。7、用PBS洗4次，每次5min。8、在组织切片上直接滴加新鲜配制的0.05％DAB溶液，室温显色3～6min。9、用蒸馏水洗4次，前3次每次1min，最后1次5min。10、于室温用甲基绿进行复染10min。用蒸馏水洗3次，前两次将载玻片提起放下10次，最后1次静置30s。依同样方法再用％正丁醇洗三次。11、用二甲苯脱水3次，每次2min，封片、干燥后，在光学显微镜下观察并记录实验结果。（三）注意事项一定要设立阳性和阴性细胞对照。阳性对照的切片可使用DNaseI部分降解的标本，阳性细胞对照可使用地塞米松（1μM）处理3-4hr的大、小鼠胸腺细胞或人外周血淋巴细胞。阴性对照不加TdT酶，其余步骤与实验组相同。
TUNEL改良方法在细胞凋亡检测中的应用
材料和方法1.1材料取手术下新鲜组织，恒冷切片5μm，4%多聚甲醛缓冲液固定4-8小时，载玻片用APES处理，同时连续切片、1%火棉胶、0.01MPpH7.4PBS、3%H2O2、1.0M枸橼酸盐缓冲液、通透液(0.1%Triton-、0.1枸橼酸钠)、标记缓冲液(pH6.8)：二甲胂酸钠mmol/L标记、二巯基苏糖醇0.1mmol/L，氯化钴(coci)。
*TdT反应液；标记缓冲液(pH6.8)中加TdT酶U/ml，biotin-dUTP；链霉菌素标记的辣根过氧化物酶，蛋白酶K(20μg/ml)。
*显色剂氨乙基咔唑(aminoethylcarbazole,AEC)的配制AEC20mg二甲酰胺DMF2.5ml0.05M醋酸缓冲液(pH5.5)50ml0.3%H2O20.5ml
1.2实验步骤（1）切片用冷风吹干后为防止冰冻切片脱片用1%火棉胶封片1分钟，PBS漂洗3×5分钟；（2）3%H2O2阻断10分钟后PBS洗3×5分钟；（3）组织切片浸泡于盛有1.0mol/L枸橼酸盐缓冲液的烧杯中，置于微波炉内，在W，辐射时间15min的条件下进行组织处理。冷却至室温。（4）放在通透液（0.1%Triton-溶于0.1%枸橼酸钠溶液）中室温20分钟，PBS漂洗3×5分钟；（5）滴加50μlTdT反应液37℃1h，PBS漂洗3×5分钟；(6)滴加50μlbiotin-dUTP，反应液37℃1h，PBS漂洗3×5分钟；(7)滴加50μl链霉菌标记辣根过氧化物酶液37℃孵育30分钟，(8)PBS漂洗3×5分钟，AEC-H2O2显色10-15分钟，苏木素复染(用1%的酸性水分化)，水洗、水溶性封片。阳性对照dTd反应前用20μg/ml蛋白酶K处理切片。阴性对照用PBS代替dTd反应液。
1.3结果判断及标准改良的方法：凋亡细胞核呈红色固缩，有白边集或碎列，细胞膜皱褶，有的卷曲和出泡，在计数时避开坏死区域，以避免假阳性。计数个细胞中的凋亡细胞数目，得出凋亡百分率。凋亡染色分度如下：每个高倍视野平均1-3个为Ⅰ级；3-6个为Ⅱ级；6-10个为Ⅲ级；10个者为IV级。阳性对照：经在dTd反应认前用20μg/ml蛋白酶，处理切片30分钟的切片同改良方法基本相同，但红色较浅。阴性对照：切片无棕色反应。
评价正常的或正在增殖的细胞没有DNA的断裂，没有3’-OH末端被标记，因此镜下无显色的物质。这种分子生物学与形态学相结合的方法，可以对完整的单个凋亡细胞核或凋亡小体进行标记，准确反应细胞凋亡最典型的生物化学与形态学特征，灵敏度远远高于一般的组织化学和生物化学方法。在检测过程中，可设阴性对照(不加TdT)阳性对照(已知的阳性标本)。注意:AEC孵育切片，反应产物为红色。可用苏木精对衬染色，反应产物是纯酒精溶性的，因此。可用酸性水溶液分化，然后用水溶性封固剂封片。
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